Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF8Q9UPP1 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms