Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8J3-201ENST00000301529 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445248.1-201ENST00000366152 624 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPM1-201ENST00000371582 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092634.3-201ENST00000450544 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073551.1-201ENST00000450741 834 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms