Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SYT9Q86SS6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms