Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms