Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms