Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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