Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms