Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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