Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms