Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGB3BPQ13352 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3BPQ13352 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3BPQ13352 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3BPQ13352 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3BPQ13352 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3BPQ13352 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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