Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms