Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms