Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms