Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LMO4P61968 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms