Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP7P55210 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP7P55210 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP7P55210 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP7P55210 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP7P55210 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP7P55210 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP7P55210 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP7P55210 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP7P55210 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP7P55210 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP7P55210 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP7P55210 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP7P55210 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP7P55210 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP7P55210 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms