Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms