Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms