Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms