Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA3P32297 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms