Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms