Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 AL031773.1-201ENST00000453579 554 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRHP20396 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRHP20396 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 AKR1C5P-201ENST00000427165 609 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 ADIPOR1P2-201ENST00000554199 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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