Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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