Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms