Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms