Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms