Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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