Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP28Q9P2N2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms