Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms