Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms