Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD5Q9P267 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBD5Q9P267 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBD5Q9P267 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBD5Q9P267 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBD5Q9P267 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBD5Q9P267 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBD5Q9P267 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBD5Q9P267 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBD5Q9P267 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBD5Q9P267 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms