Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGIP1Q9BQI5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGIP1Q9BQI5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGIP1Q9BQI5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms