Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms