Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIN3AQ96ST3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms