Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMARCE1Q969G3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms