Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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RNF148Q8N7C7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RNF148Q8N7C7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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