Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RASSF3Q86WH2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms