Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RFPL4BQ6ZWI9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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