Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LYSMD3-204ENST00000509384 1538 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 APOBEC2-201ENST00000244669 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CST8-201ENST00000246012 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SARNP-201ENST00000336133 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 OBP2A-201ENST00000340780 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RFPL4AL1-201ENST00000341750 908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CD79B-202ENST00000349817 378 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 OBP2B-202ENST00000372034 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP4-2-201ENST00000377726 763 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL132709.1-202ENST00000448840 588 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CAPNS2-201ENST00000457326 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL137247.1-201ENST00000461502 764 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ST3GAL6-207ENST00000468553 715 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RPL12P6-201ENST00000495231 498 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01324-202ENST00000497379 838 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC116359.1-201ENST00000510731 1099 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CYP4F44P-201ENST00000520423 412 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC022639.1-203ENST00000521958 579 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DHDDS-216ENST00000525682 1235 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf70-202ENST00000526781 845 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAU-206ENST00000529259 1125 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AAMDC-211ENST00000533193 606 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PCAT29-203ENST00000559212 647 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC068722.1-201ENST00000560705 861 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NARF-IT1-201ENST00000584012 769 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AP001010.1-201ENST00000588397 538 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SRD5A3-AS1-212ENST00000601433 754 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AP000962.1-201ENST00000602654 729 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC117498.3-201ENST00000605409 511 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AP000345.2-201ENST00000608615 1081 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AP001877.1-201ENST00000611253 484 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms