Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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