Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IMPG1Q17R60 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms