Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
GABRA6Q16445 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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