Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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