Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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