Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGB3BPQ13352 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3BPQ13352 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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