Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXC1Q12948 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms