Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNA1Q09470 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms