Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EGR3Q06889 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms