Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms