Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms