Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms